转录辅助因子对各有不同类型的核心启动子具有特异性

2022-01-24 04:28:26 来源:

甲基化辅助因子（transcriptional cofactor， COF）在增强子与位点二者之间传递调控谜团，是甲基化转录和基因组表达的两大效应物。虽然已得出结论某些COF比其他COF非常一般而言某些位点多种类型，但是相异COF对相异位点显示出的内在甲基化的程度由此可知不清楚。在一项属于自己深入研究中都，来自波兰维也纳生物中都心分子生物学深入研究室的深入研究医务人员在黑腹酵母菌S2巨噬细胞中都使用高通量位点活性测定来筛选23个COF转录7.2万个候选两大位点（core promoter， CP）的能力。相关深入研究结果于2019年5月15日因特网发表在Nature期刊上，论文标题为“Transcriptional cofactors display specificity for distinct types of core promoters”。这些深入研究医务人员观察到两大位点的相似之处转录，这确实COF与特定多种类型的两大位点二者之间发挥作用着相异的调节一般而言或者说“完整性（compatibilities）”。这些功能相异的两大位点在TATA盒子、下游位点模组（downstream promoter element， DPE）和TCT基序等仅有的多肽模组上相似之处性地富集，并在内源性位点上显示出相异的染色质特性。例外的是，这些两大位点多种类型在它们的H3K4me3和H3K4me1标记上发挥作用相异的相对丰度，这确实这些组蛋白修饰可能尽可能区别于反式调节因子而不是位点和增强子多种类型的底物调节模组。这些深入研究医务人员得出结论在人巨噬细胞和另外两种酵母菌巨噬细胞中都得出结论了相异COF-两大位点完整性的发挥作用。为此，他们见到了分别一般而言TATA盒子和CpG岛位点的COF。COF和两大位点二者之间的相异完整性尽可能推论相异的增强子如何甲基化地转录相异组的基因组、相同基因组内的MA位点（alternative promoter）和相同位点内的相异甲基化是从位点。综上所述，COF-两大位点完整性可能是酵母菌和进化等相异品种中都相异甲基化机制的基础。原始出处：Haberle V1， Arnold CD1， Pagani M1， et al.Transcriptional cofactors display specificity for distinct types of core promoters.Nature. 2019 May 15. doi： 10.1038/s41586-019-1210-7. [Epub ahead of print]